Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
DHX38Q92620 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX38Q92620 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX38Q92620 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX38Q92620 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms