Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN9

IPCEF1, Interactor protein for cytohesin exchange factors 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPCEF1Q8WWN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IPCEF1Q8WWN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IPCEF1Q8WWN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
IPCEF1Q8WWN9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IPCEF1Q8WWN9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms