Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLQ8NG68 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLQ8NG68 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TTLQ8NG68 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TTLQ8NG68 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms