Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM58Q8NG06 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM58Q8NG06 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM58Q8NG06 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM58Q8NG06 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms