Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CADM4Q8NFZ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CADM4Q8NFZ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CADM4Q8NFZ8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms