Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C17orf47Q8NEP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C17orf47Q8NEP4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C17orf47Q8NEP4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms