Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
LTBP4Q8N2S1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
LTBP4Q8N2S1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LTBP4Q8N2S1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC35■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LTBP4Q8N2S1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
LTBP4Q8N2S1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms