Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1A0

KRT222, Keratin-like protein KRT222, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT222Q8N1A0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT222Q8N1A0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT222Q8N1A0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT222Q8N1A0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT222Q8N1A0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms