Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPUSD2Q8IZ73 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPUSD2Q8IZ73 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPUSD2Q8IZ73 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RPUSD2Q8IZ73 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms