Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYX3

CCDC116, Coiled-coil domain-containing protein 116, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC116Q8IYX3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC116Q8IYX3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC116Q8IYX3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC116Q8IYX3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms