Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HACE1Q8IYU2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACE1Q8IYU2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACE1Q8IYU2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACE1Q8IYU2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms