Protein–RNA interactions for Protein: Q86XE0

SNX32, Sorting nexin-32, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX32Q86XE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNX32Q86XE0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX32Q86XE0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX32Q86XE0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms