Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC01551Q86U37 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01551Q86U37 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms