Protein–RNA interactions for Protein: Q71U36

TUBA1A, Tubulin alpha-1A chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1AQ71U36 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA1AQ71U36 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA1AQ71U36 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBA1AQ71U36 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms