Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC149Q6ZUS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCDC149Q6ZUS6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC149Q6ZUS6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms