Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC171Q6TFL3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC171Q6TFL3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC171Q6TFL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC171Q6TFL3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC171Q6TFL3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms