Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C3orf33Q6P1S2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C3orf33Q6P1S2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
C3orf33Q6P1S2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C3orf33Q6P1S2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms