Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1R3

MSANTD2, Myb/SANT-like DNA-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSANTD2Q6P1R3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MSANTD2Q6P1R3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSANTD2Q6P1R3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MSANTD2Q6P1R3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms