Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H3F3CQ6NXT2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H3F3CQ6NXT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms