Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EFCAB12Q6NXP0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
EFCAB12Q6NXP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EFCAB12Q6NXP0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EFCAB12Q6NXP0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.7 ms