Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM71E1Q6IPT2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM71E1Q6IPT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71E1Q6IPT2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM71E1Q6IPT2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms