Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKK2

TTC19, Tetratricopeptide repeat protein 19, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19Q6DKK2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC19Q6DKK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC19Q6DKK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC19Q6DKK2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTC19Q6DKK2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms