Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
C1orf53Q5VUE5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
C1orf53Q5VUE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
C1orf53Q5VUE5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
C1orf53Q5VUE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms