Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQI0

ATAT1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAT1Q5SQI0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATAT1Q5SQI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATAT1Q5SQI0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATAT1Q5SQI0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATAT1Q5SQI0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 954.1 ms