Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
WDR44Q5JSH3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
WDR44Q5JSH3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
WDR44Q5JSH3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
WDR44Q5JSH3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms