Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A13Q5J8X5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MS4A13Q5J8X5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MS4A13Q5J8X5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MS4A13Q5J8X5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms