Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SVEP1Q4LDE5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SVEP1Q4LDE5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SVEP1Q4LDE5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms