Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC34.96■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
NBPF8Q3BBV2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
NBPF8Q3BBV2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
NBPF8Q3BBV2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NBPF8Q3BBV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NBPF8Q3BBV2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.8 ms