Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HLA-BQ31612 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HLA-BQ31612 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-BQ31612 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-BQ31612 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms