Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMU1Q2TAY7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMU1Q2TAY7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMU1Q2TAY7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms