Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GEN1Q17RS7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GEN1Q17RS7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GEN1Q17RS7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GEN1Q17RS7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
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