Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC85BQ15834 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85BQ15834 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC85BQ15834 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC85BQ15834 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
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