Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITSN1Q15811 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ITSN1Q15811 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ITSN1Q15811 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ITSN1Q15811 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ITSN1Q15811 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ITSN1Q15811 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITSN1Q15811 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITSN1Q15811 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITSN1Q15811 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
ITSN1Q15811 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ITSN1Q15811 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ITSN1Q15811 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ITSN1Q15811 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITSN1Q15811 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ITSN1Q15811 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ITSN1Q15811 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITSN1Q15811 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ITSN1Q15811 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ITSN1Q15811 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ITSN1Q15811 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ITSN1Q15811 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITSN1Q15811 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms