Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
EEA1Q15075 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
EEA1Q15075 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC40.31■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.28■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
EEA1Q15075 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
EEA1Q15075 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
EEA1Q15075 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
EEA1Q15075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms