Protein–RNA interactions for Protein: Q15053

KIAA0040, Uncharacterized protein KIAA0040, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0040Q15053 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIAA0040Q15053 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KIAA0040Q15053 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KIAA0040Q15053 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KIAA0040Q15053 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
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