Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMC1AQ14683 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SMC1AQ14683 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SMC1AQ14683 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms