Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SQLEQ14534 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SQLEQ14534 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SQLEQ14534 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
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