Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGLL4Q14135 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VGLL4Q14135 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGLL4Q14135 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGLL4Q14135 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VGLL4Q14135 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
VGLL4Q14135 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
VGLL4Q14135 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VGLL4Q14135 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VGLL4Q14135 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
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