Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MKRN4PQ13434 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MKRN4PQ13434 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MKRN4PQ13434 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MKRN4PQ13434 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MKRN4PQ13434 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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