Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 DAXX-204ENST00000446403 702 ntTSL 316.44■□□□□ 0.222e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 VPS33A-208ENST00000543633 2019 ntTSL 516.3■□□□□ 0.22e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 DAXX-209ENST00000477370 756 ntTSL 316.19■□□□□ 0.182e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PES1-206ENST00000406208 871 ntTSL 515.96■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PSMD6-209ENST00000482510 1176 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SIN3A-202ENST00000394947 6737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PES1-209ENST00000466614 713 ntTSL 214.45□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PES1-211ENST00000477762 513 ntTSL 513.93□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 VPS33A-201ENST00000267199 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 DAXX-206ENST00000453407 801 ntTSL 513.66□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 DOCK6-207ENST00000587656 4009 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 EIF3D-204ENST00000426531 710 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 JAK1-202ENST00000465376 814 ntTSL 311.94□□□□□ -0.52e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 LMO7-213ENST00000497947 995 ntTSL 510.57□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PES1-207ENST00000433575 560 ntTSL 510.48□□□□□ -0.732e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PSMD6-203ENST00000463139 2621 ntTSL 29.79□□□□□ -0.842e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 RALGAPA2-204ENST00000430436 8769 ntTSL 59.63□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NUP98-214ENST00000527104 705 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-224ENST00000534814 512 ntTSL 59.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-211ENST00000527964 554 ntTSL 49.11□□□□□ -0.952e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-203ENST00000525021 735 ntTSL 58.63□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-219ENST00000533538 1281 ntTSL 28.63□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SIN3A-207ENST00000566640 944 ntTSL 28.6□□□□□ -1.032e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ANKS4B-201ENST00000311620 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-225ENST00000602788 4698 ntTSL 58.36□□□□□ -1.072e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PSMD6-204ENST00000467853 4583 ntTSL 1 (best)7.52□□□□□ -1.212e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 LMO7-212ENST00000489941 597 ntTSL 26.91□□□□□ -1.32e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 LMO7-222ENST00000532785 599 ntTSL 26.72□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PSMD6-208ENST00000480205 657 ntTSL 36.06□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.462e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-204ENST00000525037 1406 ntTSL 55.54□□□□□ -1.522e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NUP98-216ENST00000529379 536 ntTSL 35.52□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 NPEPPS-209ENST00000527360 534 ntTSL 54.02□□□□□ -1.772e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 LMO7-216ENST00000525373 672 ntTSL 41.97□□□□□ -2.092e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ANXA4-204ENST00000460439 543 ntTSL 417.22■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ANXA4-211ENST00000487351 552 ntTSL 216.6■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ANXA4-212ENST00000635311 1492 ntTSL 215.27■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ANXA4-205ENST00000460942 576 ntTSL 513.87□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 VARS-219ENST00000461328 662 ntTSL 319.04■□□□□ 0.643e-7■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ADRM1-202ENST00000462554 735 ntTSL 331.75■■■□□ 2.675e-7■■■■□ 22
G3BP1Q13283 ADRM1-203ENST00000465805 630 ntTSL 218.83■□□□□ 0.65e-7■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-217ENST00000637001 1609 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-212ENST00000636030 1636 ntTSL 511.41□□□□□ -0.583e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-221ENST00000637845 2472 ntTSL 511.25□□□□□ -0.613e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-216ENST00000636992 1514 ntTSL 510.95□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-220ENST00000637562 1524 ntTSL 510.42□□□□□ -0.743e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-222ENST00000637969 2889 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-205ENST00000464071 1065 ntTSL 28.01□□□□□ -1.133e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.173e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SEC23B-204ENST00000377475 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SEC23B-203ENST00000377465 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 SEC23B-202ENST00000336714 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PABPC1-205ENST00000518196 631 ntTSL 316.1■□□□□ 0.172e-14■■■■□ 22
G3BP1Q13283 PSMC3-202ENST00000524447 935 ntTSL 318.77■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 EIF3D-206ENST00000455547 996 ntTSL 512.13□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 KTN1-201ENST00000334975 2485 ntTSL 28.82□□□□□ -13e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.583e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 KTN1-210ENST00000553624 731 ntTSL 54.93□□□□□ -1.623e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 KTN1-220ENST00000555172 1985 ntTSL 24.56□□□□□ -1.683e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.013e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 CRYZ-205ENST00000417775 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.393e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 CRYZ-201ENST00000340866 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.333e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.473e-6■■■■□ 22
G3BP1Q13283 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.47e-6■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.77e-6■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 NBAS-208ENST00000442506 4391 ntTSL 1 (best)13.34□□□□□ -0.275e-11■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 NBAS-201ENST00000281513 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-11■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 TSG101-212ENST00000584526 912 ntTSL 56.94□□□□□ -1.37e-6■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 NBAS-207ENST00000441755 844 ntTSL 36.77□□□□□ -1.335e-11■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 NBAS-205ENST00000429842 638 ntTSL 35.4□□□□□ -1.545e-11■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 TSG101-205ENST00000540555 571 ntTSL 24.44□□□□□ -1.77e-6■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 AATF-202ENST00000613840 648 ntTSL 223.9■■□□□ 1.427e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.167e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 232.62■■■□□ 2.819e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.379e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.459e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.494e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 IPO4-205ENST00000558233 1015 ntTSL 519.25■□□□□ 0.678e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 PSMA4-203ENST00000557929 635 ntTSL 59.17□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 FTSJ3-209ENST00000580376 575 ntTSL 311.64□□□□□ -0.553e-6■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 MARS-215ENST00000548944 294 ntTSL 317.39■□□□□ 0.377e-7■■■■□ 21.9
G3BP1Q13283 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-8■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 PSMC4-203ENST00000593455 1532 ntTSL 518.43■□□□□ 0.542e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 PSMC4-206ENST00000601697 1623 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 RPS26-201ENST00000356464 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.132e-6■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 RPS26-203ENST00000552361 623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.412e-6■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 RPS26-202ENST00000548590 1204 ntTSL 511.89□□□□□ -0.512e-6■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 NSFL1C-209ENST00000489203 694 ntTSL 327.14■■□□□ 1.942e-8■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 ADD1-222ENST00000536424 594 ntTSL 518.96■□□□□ 0.634e-7■■■■□ 21.8
G3BP1Q13283 ADD1-227ENST00000541051 975 ntTSL 215.35■□□□□ 0.054e-7■■■■□ 21.8
Retrieved 100 of 11,245 protein–RNA pairs in 635.7 ms