RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592704.5

SRP68-211, Transcript of signal recognition particle 68, humanhuman

TSL 2

Gene SRP68, Length 1,941 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68-211ENST00000592704 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.02■■■■■ 7.36
SRP68-211ENST00000592704 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.59■■■■■ 6.17
SRP68-211ENST00000592704 ABCC9O60706 1549 aa51.36■■■■■ 5.81
SRP68-211ENST00000592704 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.1■■■■■ 5.77
SRP68-211ENST00000592704 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.83■■■■■ 5.73
SRP68-211ENST00000592704 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.41■■■■■ 5.66
SRP68-211ENST00000592704 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.08■■■■■ 5.61
SRP68-211ENST00000592704 NACADO15069 1562 aa50.08■■■■■ 5.61
SRP68-211ENST00000592704 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.87■■■■■ 5.57
SRP68-211ENST00000592704 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.38■■■■■ 5.5
SRP68-211ENST00000592704 SCRIBQ14160 1630 aa49.22■■■■■ 5.47
SRP68-211ENST00000592704 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.79■■■■■ 5.4
SRP68-211ENST00000592704 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.28■■■■■ 5.32
SRP68-211ENST00000592704 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.26■■■■■ 5.32
SRP68-211ENST00000592704 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.46■■■■■ 5.19
SRP68-211ENST00000592704 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.23■■■■■ 5.15
SRP68-211ENST00000592704 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.18■■■■■ 5.14
SRP68-211ENST00000592704 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.11■■■■■ 5.13
SRP68-211ENST00000592704 SMARCA4P51532 1647 aa47.09■■■■■ 5.13
SRP68-211ENST00000592704 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.04■■■■■ 5.12
SRP68-211ENST00000592704 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.93■■■■■ 5.1
SRP68-211ENST00000592704 WIZO95785 1651 aa46.73■■■■■ 5.07
SRP68-211ENST00000592704 SMARCA2P51531 1590 aa46.48■■■■■ 5.03
SRP68-211ENST00000592704 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.48■■■■■ 5.03
SRP68-211ENST00000592704 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.47■■■■■ 5.03
SRP68-211ENST00000592704 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.44■■■■■ 5.02
SRP68-211ENST00000592704 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.24■■■■■ 4.99
SRP68-211ENST00000592704 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.22■■■■■ 4.99
SRP68-211ENST00000592704 NCAPD3P42695 1498 aa46.17■■■■■ 4.98
SRP68-211ENST00000592704 HMGXB3Q12766 1538 aa46.08■■■■■ 4.97
SRP68-211ENST00000592704 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.83■■■■■ 4.93
SRP68-211ENST00000592704 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.72■■■■■ 4.91
SRP68-211ENST00000592704 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.98■■■■■ 4.79
SRP68-211ENST00000592704 CFTRP13569 1480 aa44.96■■■■■ 4.79
SRP68-211ENST00000592704 NESP48681 1621 aa44.82■■■■■ 4.77
SRP68-211ENST00000592704 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.79■■■■■ 4.76
SRP68-211ENST00000592704 PRDM2Q13029 1718 aa44.76■■■■■ 4.76
SRP68-211ENST00000592704 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.67■■■■■ 4.74
SRP68-211ENST00000592704 ABCC8Q09428 1581 aa44.56■■■■■ 4.72
SRP68-211ENST00000592704 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.51■■■■■ 4.72
SRP68-211ENST00000592704 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.49■■■■■ 4.71
SRP68-211ENST00000592704 TRIM41Q8WV44 630 aa44.42■■■■■ 4.7
SRP68-211ENST00000592704 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.37■■■■■ 4.69
SRP68-211ENST00000592704 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.34■■■■■ 4.69
SRP68-211ENST00000592704 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.32■■■■■ 4.68
SRP68-211ENST00000592704 ERCC6Q03468 1493 aa44.19■■■■■ 4.67
SRP68-211ENST00000592704 SYNJ1O43426 1573 aa44.18■■■■■ 4.66
SRP68-211ENST00000592704 CUX1P39880 1505 aa44.1■■■■■ 4.65
SRP68-211ENST00000592704 TOP2BQ02880 1626 aa44.07■■■■■ 4.65
SRP68-211ENST00000592704 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.03■■■■■ 4.64
SRP68-211ENST00000592704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.98■■■■■ 4.63
SRP68-211ENST00000592704 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.95■■■■■ 4.63
SRP68-211ENST00000592704 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.94■■■■■ 4.62
SRP68-211ENST00000592704 TOPBP1Q92547 1522 aa43.92■■■■■ 4.62
SRP68-211ENST00000592704 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.78■■■■■ 4.6
SRP68-211ENST00000592704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
SRP68-211ENST00000592704 WDR62O43379 1518 aa43.7■■■■■ 4.59
SRP68-211ENST00000592704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.66■■■■■ 4.58
SRP68-211ENST00000592704 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
SRP68-211ENST00000592704 SOGA1O94964 1423 aa43.55■■■■■ 4.56
SRP68-211ENST00000592704 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.51■■■■■ 4.56
SRP68-211ENST00000592704 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.4■■■■■ 4.54
SRP68-211ENST00000592704 CUX2O14529 1486 aa43.39■■■■■ 4.54
SRP68-211ENST00000592704 EEA1Q15075 1411 aa43.35■■■■■ 4.53
SRP68-211ENST00000592704 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.34■■■■■ 4.53
SRP68-211ENST00000592704 KIF27Q86VH2 1401 aa43.33■■■■■ 4.53
SRP68-211ENST00000592704 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
SRP68-211ENST00000592704 IFT140Q96RY7 1462 aa43.29■■■■■ 4.52
SRP68-211ENST00000592704 WDR97A6NE52 1622 aa43.26■■■■■ 4.52
SRP68-211ENST00000592704 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.19■■■■■ 4.5
SRP68-211ENST00000592704 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
SRP68-211ENST00000592704 EHMT2Q96KQ7 1210 aa43.07■■■■■ 4.48
SRP68-211ENST00000592704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.05■■■■■ 4.48
SRP68-211ENST00000592704 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.05■■■■■ 4.48
SRP68-211ENST00000592704 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.04■■■■■ 4.48
SRP68-211ENST00000592704 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.489e-7■■■■■ 31.4
SRP68-211ENST00000592704 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.97■■■■■ 4.47
SRP68-211ENST00000592704 IGF1RP08069 1367 aa42.94■■■■■ 4.46
SRP68-211ENST00000592704 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.93■■■■■ 4.46
SRP68-211ENST00000592704 PBRM1Q86U86 1689 aa42.88■■■■■ 4.46
SRP68-211ENST00000592704 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.85■■■■■ 4.45
SRP68-211ENST00000592704 GRIN2BQ13224 1484 aa42.82■■■■■ 4.45
SRP68-211ENST00000592704 KIF21BO75037 1637 aa42.81■■■■■ 4.44
SRP68-211ENST00000592704 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.77■■■■■ 4.44
SRP68-211ENST00000592704 CUL7Q14999 1698 aa42.76■■■■■ 4.44
SRP68-211ENST00000592704 PRXQ9BXM0 1461 aa42.76■■■■■ 4.44
SRP68-211ENST00000592704 GOLGA3Q08378 1498 aa42.74■■■■■ 4.43
SRP68-211ENST00000592704 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa42.7■■■■■ 4.43
SRP68-211ENST00000592704 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
SRP68-211ENST00000592704 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.62■■■■■ 4.41
SRP68-211ENST00000592704 ADAMTS12P58397 1594 aa42.57■■■■■ 4.4
SRP68-211ENST00000592704 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.56■■■■■ 4.4
SRP68-211ENST00000592704 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.53■■■■■ 4.4
SRP68-211ENST00000592704 FBLN2P98095 1184 aa42.42■■■■■ 4.38
SRP68-211ENST00000592704 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.42■■■■■ 4.38
SRP68-211ENST00000592704 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.4■■■■■ 4.38
SRP68-211ENST00000592704 SYNJ2O15056 1496 aa42.38■■■■■ 4.37
SRP68-211ENST00000592704 GRIN2AQ12879 1464 aa42.28■■■■■ 4.36
SRP68-211ENST00000592704 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
SRP68-211ENST00000592704 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.2■■■■■ 4.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.6 ms