Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NR1H3Q13133 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NR1H3Q13133 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NR1H3Q13133 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NR1H3Q13133 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
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