Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BNIP3Q12983 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNIP3Q12983 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP3Q12983 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP3Q12983 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms