Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
HMGXB3Q12766 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC44.12■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC44.12■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC44.11■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC44.1■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC44.08■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC44.08■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC44.08■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.07■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.65
HMGXB3Q12766 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC44.03■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.03■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC44.02■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC44.02■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
HMGXB3Q12766 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC43.99■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.99■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC43.97■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.63
HMGXB3Q12766 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC43.92■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC43.9■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
HMGXB3Q12766 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.87■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC43.87■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
HMGXB3Q12766 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms