Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SMAGPQ0VAQ4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMAGPQ0VAQ4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms