Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CD47Q08722 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CD47Q08722 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD47Q08722 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD47Q08722 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD47Q08722 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD47Q08722 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD47Q08722 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD47Q08722 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD47Q08722 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD47Q08722 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD47Q08722 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD47Q08722 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD47Q08722 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD47Q08722 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD47Q08722 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD47Q08722 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD47Q08722 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD47Q08722 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CD47Q08722 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD47Q08722 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD47Q08722 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD47Q08722 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CD47Q08722 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD47Q08722 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD47Q08722 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD47Q08722 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD47Q08722 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD47Q08722 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD47Q08722 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD47Q08722 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD47Q08722 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD47Q08722 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD47Q08722 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD47Q08722 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms