Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDH1Q08174 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDH1Q08174 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCDH1Q08174 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCDH1Q08174 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms