Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPN12Q05209 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
PTPN12Q05209 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPN12Q05209 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPN12Q05209 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPN12Q05209 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms