Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHRNEQ04844 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHRNEQ04844 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNEQ04844 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms