Protein–RNA interactions for Protein: Q01518

CAP1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAP1Q01518 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CAP1Q01518 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CAP1Q01518 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CAP1Q01518 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CAP1Q01518 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms